Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD13Q5VXD3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD13Q5VXD3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SAMD13Q5VXD3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD13Q5VXD3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD13Q5VXD3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD13Q5VXD3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms