Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF3Q5VWG9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF3Q5VWG9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms