Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GARNL3Q5VVW2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms