Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO4Q5TGY1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO4Q5TGY1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms