Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP40Q5TG30 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP40Q5TG30 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP40Q5TG30 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP40Q5TG30 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP40Q5TG30 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP40Q5TG30 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP40Q5TG30 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP40Q5TG30 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP40Q5TG30 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP40Q5TG30 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP40Q5TG30 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP40Q5TG30 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP40Q5TG30 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP40Q5TG30 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP40Q5TG30 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP40Q5TG30 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP40Q5TG30 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARHGAP40Q5TG30 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms