Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HABP4Q5JVS0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HABP4Q5JVS0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms