Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF260Q3ZCT1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms