Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKIDA1Q1XH10 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SKIDA1Q1XH10 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIDA1Q1XH10 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms