Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LONRF1Q17RB8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LONRF1Q17RB8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
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