Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN21Q16825 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN21Q16825 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN21Q16825 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
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