Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAPC1Q16533 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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SNAPC1Q16533 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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SNAPC1Q16533 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAPC1Q16533 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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