Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SURF1Q15526 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
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