Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARHGEF6Q15052 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARHGEF6Q15052 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF6Q15052 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF6Q15052 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF6Q15052 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms