Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB33AQ14088 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB33AQ14088 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB33AQ14088 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB33AQ14088 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB33AQ14088 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB33AQ14088 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB33AQ14088 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB33AQ14088 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB33AQ14088 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB33AQ14088 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB33AQ14088 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB33AQ14088 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB33AQ14088 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB33AQ14088 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB33AQ14088 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB33AQ14088 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB33AQ14088 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB33AQ14088 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB33AQ14088 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB33AQ14088 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB33AQ14088 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
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