Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1DQ13901 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1DQ13901 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1DQ13901 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1DQ13901 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1DQ13901 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1DQ13901 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C1DQ13901 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1DQ13901 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1DQ13901 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1DQ13901 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1DQ13901 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1DQ13901 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1DQ13901 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1DQ13901 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1DQ13901 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1DQ13901 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1DQ13901 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1DQ13901 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1DQ13901 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1DQ13901 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1DQ13901 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1DQ13901 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1DQ13901 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C1DQ13901 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1DQ13901 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1DQ13901 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1DQ13901 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1DQ13901 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1DQ13901 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1DQ13901 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1DQ13901 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1DQ13901 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1DQ13901 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1DQ13901 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1DQ13901 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1DQ13901 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1DQ13901 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C1DQ13901 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1DQ13901 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1DQ13901 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1DQ13901 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1DQ13901 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1DQ13901 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1DQ13901 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1DQ13901 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C1DQ13901 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1DQ13901 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1DQ13901 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1DQ13901 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1DQ13901 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1DQ13901 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1DQ13901 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1DQ13901 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1DQ13901 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1DQ13901 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1DQ13901 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1DQ13901 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1DQ13901 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1DQ13901 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1DQ13901 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1DQ13901 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1DQ13901 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1DQ13901 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C1DQ13901 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1DQ13901 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1DQ13901 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1DQ13901 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1DQ13901 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1DQ13901 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1DQ13901 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1DQ13901 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1DQ13901 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1DQ13901 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1DQ13901 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1DQ13901 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1DQ13901 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1DQ13901 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1DQ13901 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1DQ13901 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1DQ13901 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1DQ13901 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1DQ13901 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1DQ13901 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1DQ13901 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C1DQ13901 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1DQ13901 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1DQ13901 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1DQ13901 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1DQ13901 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1DQ13901 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1DQ13901 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1DQ13901 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1DQ13901 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1DQ13901 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1DQ13901 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1DQ13901 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1DQ13901 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1DQ13901 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1DQ13901 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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