Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRR1Q13601 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRR1Q13601 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRR1Q13601 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRR1Q13601 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRR1Q13601 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRR1Q13601 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRR1Q13601 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRR1Q13601 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRR1Q13601 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRR1Q13601 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRR1Q13601 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRR1Q13601 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRR1Q13601 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRR1Q13601 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRR1Q13601 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRR1Q13601 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.31■■□□□ 1
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