Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA1Q13136 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA1Q13136 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA1Q13136 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms