Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHAF1BQ13112 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
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