Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT88Q13099 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT88Q13099 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms