Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBL2Q08999 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RBL2Q08999 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RBL2Q08999 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBL2Q08999 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBL2Q08999 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBL2Q08999 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBL2Q08999 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RBL2Q08999 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBL2Q08999 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBL2Q08999 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBL2Q08999 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBL2Q08999 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBL2Q08999 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBL2Q08999 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBL2Q08999 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBL2Q08999 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RBL2Q08999 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBL2Q08999 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms