Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GABPB1Q06547 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABPB1Q06547 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms