Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 VNX1YNL321W 2727 nt5.51□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 RPL7AYGL076C 735 nt5.51□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 PAN6YIL145C 930 nt5.51□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 MRPL22YNL177C 930 nt5.51□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 RPL7BYPL198W 735 nt5.51□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 YBR144CYBR144C 315 nt5.51□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 MID1YNL291C 1647 nt5.51□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 TEP1YNL128W 1305 nt5.5□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 TUL1YKL034W 2277 nt5.5□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 ADE13YLR359W 1449 nt5.5□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.5□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.5□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.5□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.5□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.5□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 RPE1YJL121C 717 nt5.5□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 YML131WYML131W 1098 nt5.5□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 AFT1YGL071W 2073 nt5.5□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 SIP5YMR140W 1470 nt5.5□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 GSY2YLR258W 2118 nt5.5□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 YGR022CYGR022C 330 nt5.49□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.49□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 RGT1YKL038W 3513 nt5.49□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 PMT2YAL023C 2280 nt5.48□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 RIM101YHL027W 1878 nt5.48□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 KCH1YJR054W 1494 nt5.48□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 AIM17YHL021C 1398 nt5.48□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 SNZ3YFL059W 897 nt5.48□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 PHB1YGR132C 864 nt5.48□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 YKL107WYKL107W 930 nt5.48□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 SSP120YLR250W 705 nt5.48□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 VMA4YOR332W 702 nt5.48□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 MCM3YEL032W 2916 nt5.48□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 PIF1YML061C 2580 nt5.48□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 AMD1YML035C 2433 nt5.47□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 YNL247WYNL247W 2304 nt5.47□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 ELP2YGR200C 2367 nt5.47□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 NOP7YGR103W 1818 nt5.47□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 DJP1YIR004W 1299 nt5.47□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 YJL211CYJL211C 444 nt5.47□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 YNR040WYNR040W 771 nt5.47□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 MDY2YOL111C 639 nt5.47□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 GLE1YDL207W 1617 nt5.47□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 MSS116YDR194C 1995 nt5.47□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 VMA13YPR036W 1437 nt5.47□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 SPC97YHR172W 2472 nt5.47□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 PSE1YMR308C 3270 nt5.46□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 VTC2YFL004W 2487 nt5.46□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 YJU2YKL095W 837 nt5.46□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 FRS2YFL022C 1512 nt5.46□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.46□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 NPL6YMR091C 1308 nt5.46□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 PXA1YPL147W 2613 nt5.45□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 EPS1YIL005W 2106 nt5.45□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 UBX2YML013W 1755 nt5.45□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 YDL114WYDL114W 927 nt5.45□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.45□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 YME1YPR024W 2244 nt5.45□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 SNF3YDL194W 2655 nt5.44□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 KEX2YNL238W 2445 nt5.44□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 NUD1YOR373W 2556 nt5.44□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.44□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 PEX19YDL065C 1029 nt5.44□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 GIR2YDR152W 798 nt5.44□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.44□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.44□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.44□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.44□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.44□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.44□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.44□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.44□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 MKC7YDR144C 1791 nt5.44□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 YCL065WYCL065W 369 nt5.43□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 TUP1YCR084C 2142 nt5.43□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 HAP2YGL237C 798 nt5.43□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 CAX4YGR036C 720 nt5.43□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 YIL067CYIL067C 2037 nt5.42□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 YER186CYER186C 921 nt5.42□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 RRP4YHR069C 1080 nt5.42□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 RPS9AYPL081W 594 nt5.42□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 PZF1YPR186C 1290 nt5.42□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 PEX32YBR168W 1242 nt5.42□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 GAT1YFL021W 1533 nt5.42□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 ECM7YLR443W 1347 nt5.42□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 CLB1YGR108W 1416 nt5.41□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 LYS12YIL094C 1116 nt5.41□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 DAL3YIR032C 588 nt5.41□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 MRP17YKL003C 396 nt5.41□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 SCO2YBR024W 906 nt5.41□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 ERI1YPL096C-A 207 nt5.41□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 STE20YHL007C 2820 nt5.41□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 DPH2YKL191W 1605 nt5.41□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 APE3YBR286W 1614 nt5.41□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 YRA1YDR381W 681 nt5.4□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 URA3YEL021W 804 nt5.4□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 ECT1YGR007W 972 nt5.4□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 PPG1YNR032W 1107 nt5.4□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 MRPL36YBR122C 534 nt5.4□□□□□ -1.54
RRN11Q04712 PGU1YJR153W 1086 nt5.39□□□□□ -1.55
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