Protein–RNA interactions for Protein: Q04437

YKU80, ATP-dependent DNA helicase II subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKU80Q04437 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.83□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 SRN2YLR119W 642 nt5.83□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 YOL079WYOL079W 399 nt5.83□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 ALG5YPL227C 1005 nt5.83□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 TAE1YBR261C 699 nt5.83□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 QDR3YBR043C 2070 nt5.83□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 MID1YNL291C 1647 nt5.82□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 YCR006CYCR006C 474 nt5.82□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 MDH3YDL078C 1032 nt5.82□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 ASP1YDR321W 1146 nt5.82□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 OPI7YDR360W 435 nt5.82□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.82□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 TFG2YGR005C 1203 nt5.82□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 ECM14YHR132C 1293 nt5.82□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 YJU3YKL094W 942 nt5.82□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 TIP41YPR040W 1071 nt5.82□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 APE1YKL103C 1545 nt5.82□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 WHI2YOR043W 1461 nt5.82□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 IDP1YDL066W 1287 nt5.81□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 HST4YDR191W 1113 nt5.81□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 PDE1YGL248W 1110 nt5.81□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 RME1YGR044C 903 nt5.81□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 YJR115WYJR115W 510 nt5.81□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 YMR122CYMR122C 375 nt5.81□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 OSW5YMR148W 447 nt5.81□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 MRPL24YMR193W 777 nt5.81□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 MRPL10YNL284C 969 nt5.81□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 CDC1YDR182W 1476 nt5.81□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 NUD1YOR373W 2556 nt5.81□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 LCB2YDR062W 1686 nt5.81□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 RPT1YKL145W 1404 nt5.81□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 FAA4YMR246W 2085 nt5.81□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 TUL1YKL034W 2277 nt5.81□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 HOF1YMR032W 2010 nt5.81□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 SLD2YKL108W 1362 nt5.8□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 YPL245WYPL245W 1365 nt5.8□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 OSW2YLR054C 2175 nt5.8□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 RRN3YKL125W 1884 nt5.8□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 SIA1YOR137C 1869 nt5.8□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 VBA1YMR088C 1689 nt5.8□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 RPL12AYEL054C 498 nt5.8□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 MPC2YHR162W 390 nt5.8□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 RHO3YIL118W 696 nt5.8□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 LDS1YAL018C 978 nt5.8□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 MID2YLR332W 1131 nt5.8□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 RHO2YNL090W 579 nt5.8□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 RRT2YBR246W 1164 nt5.8□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 PMA1YGL008C 2757 nt5.8□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 CRF1YDR223W 1404 nt5.8□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 HSF1YGL073W 2502 nt5.8□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 YEL077CYEL077C 3834 nt5.79□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 ARH1YDR376W 1482 nt5.79□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 VAN1YML115C 1608 nt5.79□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 DRE2YKR071C 1047 nt5.79□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 TSA1YML028W 591 nt5.79□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 RPT2YDL007W 1314 nt5.78□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 STE12YHR084W 2067 nt5.78□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 SPC42YKL042W 1092 nt5.78□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 YLR317WYLR317W 435 nt5.78□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 RVB2YPL235W 1416 nt5.78□□□□□ -1.48
YKU80Q04437 MCM3YEL032W 2916 nt5.77□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 YPR196WYPR196W 1413 nt5.77□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 MDH1YKL085W 1005 nt5.77□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 RPN7YPR108W 1290 nt5.77□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 GYP1YOR070C 1914 nt5.77□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 YPK2YMR104C 2034 nt5.76□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 DBF4YDR052C 2115 nt5.76□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.76□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 RPS2YGL123W 765 nt5.76□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 HAP2YGL237C 798 nt5.76□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 SPO12YHR152W 522 nt5.76□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 CTR2YHR175W 570 nt5.76□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 TDH2YJR009C 999 nt5.76□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 SPG4YMR107W 348 nt5.76□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 TOM40YMR203W 1164 nt5.76□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 MRPS16YPL013C 366 nt5.76□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 YPL136WYPL136W 369 nt5.76□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 MSP1YGR028W 1089 nt5.75□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 VPS24YKL041W 675 nt5.75□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 ASK1YKL052C 879 nt5.75□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 MAC1YMR021C 1254 nt5.75□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 RBD2YPL246C 789 nt5.75□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 ICL1YER065C 1674 nt5.75□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 MRE11YMR224C 2079 nt5.75□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 HPF1YOL155C 2904 nt5.75□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 VMA13YPR036W 1437 nt5.74□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 LAP2YNL045W 2016 nt5.74□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 UGX2YDL169C 672 nt5.74□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 YEL068CYEL068C 333 nt5.74□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 SKI6YGR195W 741 nt5.74□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 PRS1YKL181W 1284 nt5.74□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 HAP3YBL021C 435 nt5.74□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 YPR098CYPR098C 486 nt5.74□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 VPS1YKR001C 2115 nt5.74□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 GIP1YBR045C 1920 nt5.74□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 HXT3YDR345C 1704 nt5.74□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 MDM31YHR194W 1740 nt5.74□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 NRD1YNL251C 1728 nt5.74□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 GCR2YNL199C 1605 nt5.74□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 DIA3YDL024C 1407 nt5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.1 ms