Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL18AQ02543 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL18AQ02543 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms