Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL1Q00532 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDKL1Q00532 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL1Q00532 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms