Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC5Q00444 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC5Q00444 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms