Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VLDLRP98155 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms