Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL11P62913 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL11P62913 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL11P62913 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL11P62913 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL11P62913 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL11P62913 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL11P62913 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL11P62913 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL11P62913 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL11P62913 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL11P62913 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL11P62913 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL11P62913 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL11P62913 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL11P62913 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL11P62913 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL11P62913 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL11P62913 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL11P62913 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL11P62913 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL11P62913 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL11P62913 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL11P62913 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL11P62913 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL11P62913 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL11P62913 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL11P62913 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL11P62913 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL11P62913 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL11P62913 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL11P62913 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL11P62913 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL11P62913 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL11P62913 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL11P62913 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL11P62913 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL11P62913 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL11P62913 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL11P62913 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL11P62913 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL11P62913 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL11P62913 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL11P62913 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL11P62913 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL11P62913 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL11P62913 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL11P62913 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL11P62913 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL11P62913 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL11P62913 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL11P62913 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL11P62913 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL11P62913 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL11P62913 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL11P62913 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL11P62913 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL11P62913 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL11P62913 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL11P62913 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL11P62913 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL11P62913 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL11P62913 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL11P62913 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL11P62913 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL11P62913 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL11P62913 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL11P62913 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL11P62913 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL11P62913 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL11P62913 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL11P62913 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL11P62913 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL11P62913 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL11P62913 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL11P62913 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL11P62913 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL11P62913 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL11P62913 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL11P62913 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL11P62913 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL11P62913 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL11P62913 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL11P62913 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL11P62913 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL11P62913 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL11P62913 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL11P62913 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL11P62913 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL11P62913 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL11P62913 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL11P62913 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL11P62913 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL11P62913 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL11P62913 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL11P62913 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL11P62913 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL11P62913 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL11P62913 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL11P62913 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms