Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB1AP62820 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB1AP62820 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB1AP62820 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB1AP62820 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB1AP62820 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB1AP62820 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB1AP62820 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms