Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPS2P61201 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPS2P61201 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPS2P61201 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPS2P61201 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPS2P61201 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPS2P61201 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPS2P61201 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPS2P61201 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPS2P61201 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COPS2P61201 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPS2P61201 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPS2P61201 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPS2P61201 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPS2P61201 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPS2P61201 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COPS2P61201 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPS2P61201 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPS2P61201 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPS2P61201 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COPS2P61201 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPS2P61201 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPS2P61201 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPS2P61201 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPS2P61201 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COPS2P61201 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPS2P61201 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPS2P61201 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPS2P61201 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPS2P61201 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPS2P61201 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPS2P61201 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPS2P61201 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPS2P61201 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPS2P61201 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPS2P61201 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPS2P61201 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPS2P61201 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPS2P61201 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPS2P61201 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPS2P61201 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPS2P61201 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPS2P61201 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COPS2P61201 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPS2P61201 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPS2P61201 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPS2P61201 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPS2P61201 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPS2P61201 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPS2P61201 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPS2P61201 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPS2P61201 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPS2P61201 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPS2P61201 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPS2P61201 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPS2P61201 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPS2P61201 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPS2P61201 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPS2P61201 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPS2P61201 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPS2P61201 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPS2P61201 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPS2P61201 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPS2P61201 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPS2P61201 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPS2P61201 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPS2P61201 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPS2P61201 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPS2P61201 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPS2P61201 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPS2P61201 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPS2P61201 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPS2P61201 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPS2P61201 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPS2P61201 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPS2P61201 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPS2P61201 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPS2P61201 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPS2P61201 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPS2P61201 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
COPS2P61201 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPS2P61201 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPS2P61201 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPS2P61201 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPS2P61201 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPS2P61201 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPS2P61201 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPS2P61201 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPS2P61201 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPS2P61201 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPS2P61201 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPS2P61201 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPS2P61201 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPS2P61201 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPS2P61201 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPS2P61201 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS2P61201 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS2P61201 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS2P61201 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS2P61201 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms