Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DEFA3P59666 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEFA3P59666 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms