Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATXN1P54253 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms