Protein–RNA interactions for Protein: P52435

POLR2J, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2JP52435 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2JP52435 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2JP52435 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2JP52435 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2JP52435 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2JP52435 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2JP52435 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2JP52435 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2JP52435 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2JP52435 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2JP52435 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2JP52435 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2JP52435 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2JP52435 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2JP52435 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2JP52435 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2JP52435 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2JP52435 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms