Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK3P51956 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK3P51956 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK3P51956 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK3P51956 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK3P51956 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK3P51956 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK3P51956 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK3P51956 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK3P51956 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK3P51956 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK3P51956 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK3P51956 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK3P51956 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK3P51956 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK3P51956 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK3P51956 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK3P51956 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK3P51956 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK3P51956 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK3P51956 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK3P51956 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK3P51956 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK3P51956 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK3P51956 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK3P51956 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK3P51956 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK3P51956 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK3P51956 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK3P51956 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK3P51956 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK3P51956 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK3P51956 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEK3P51956 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEK3P51956 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK3P51956 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK3P51956 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK3P51956 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK3P51956 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK3P51956 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK3P51956 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK3P51956 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK3P51956 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK3P51956 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK3P51956 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK3P51956 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK3P51956 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK3P51956 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK3P51956 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK3P51956 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK3P51956 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK3P51956 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK3P51956 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK3P51956 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK3P51956 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK3P51956 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK3P51956 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK3P51956 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK3P51956 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK3P51956 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK3P51956 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK3P51956 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK3P51956 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK3P51956 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK3P51956 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK3P51956 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK3P51956 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK3P51956 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK3P51956 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK3P51956 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK3P51956 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK3P51956 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK3P51956 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK3P51956 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK3P51956 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK3P51956 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK3P51956 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK3P51956 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK3P51956 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK3P51956 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK3P51956 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK3P51956 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK3P51956 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK3P51956 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK3P51956 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK3P51956 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK3P51956 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK3P51956 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK3P51956 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK3P51956 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK3P51956 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK3P51956 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK3P51956 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK3P51956 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK3P51956 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEK3P51956 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEK3P51956 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEK3P51956 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEK3P51956 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEK3P51956 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms