Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR5P51681 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR5P51681 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR5P51681 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR5P51681 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR5P51681 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR5P51681 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR5P51681 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR5P51681 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR5P51681 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR5P51681 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR5P51681 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR5P51681 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR5P51681 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR5P51681 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR5P51681 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR5P51681 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCR5P51681 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCR5P51681 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCR5P51681 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR5P51681 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR5P51681 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR5P51681 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR5P51681 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR5P51681 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR5P51681 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR5P51681 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR5P51681 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR5P51681 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR5P51681 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR5P51681 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR5P51681 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR5P51681 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR5P51681 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR5P51681 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR5P51681 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR5P51681 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR5P51681 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR5P51681 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR5P51681 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR5P51681 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR5P51681 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR5P51681 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR5P51681 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR5P51681 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR5P51681 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR5P51681 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR5P51681 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR5P51681 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR5P51681 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR5P51681 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR5P51681 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR5P51681 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR5P51681 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR5P51681 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR5P51681 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR5P51681 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR5P51681 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR5P51681 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR5P51681 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR5P51681 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR5P51681 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR5P51681 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR5P51681 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR5P51681 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR5P51681 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR5P51681 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR5P51681 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR5P51681 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR5P51681 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR5P51681 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR5P51681 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR5P51681 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR5P51681 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR5P51681 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR5P51681 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR5P51681 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR5P51681 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR5P51681 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR5P51681 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR5P51681 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR5P51681 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR5P51681 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR5P51681 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR5P51681 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR5P51681 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR5P51681 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR5P51681 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR5P51681 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR5P51681 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR5P51681 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR5P51681 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR5P51681 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR5P51681 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR5P51681 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR5P51681 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR5P51681 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR5P51681 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR5P51681 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR5P51681 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms