Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ETV1P50549 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ETV1P50549 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ETV1P50549 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ETV1P50549 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ETV1P50549 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ETV1P50549 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ETV1P50549 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ETV1P50549 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ETV1P50549 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ETV1P50549 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ETV1P50549 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ETV1P50549 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ETV1P50549 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ETV1P50549 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ETV1P50549 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ETV1P50549 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ETV1P50549 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ETV1P50549 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ETV1P50549 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ETV1P50549 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ETV1P50549 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ETV1P50549 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ETV1P50549 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ETV1P50549 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ETV1P50549 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ETV1P50549 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ETV1P50549 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ETV1P50549 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ETV1P50549 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ETV1P50549 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ETV1P50549 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ETV1P50549 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ETV1P50549 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ETV1P50549 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ETV1P50549 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ETV1P50549 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ETV1P50549 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ETV1P50549 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ETV1P50549 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ETV1P50549 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ETV1P50549 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ETV1P50549 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ETV1P50549 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ETV1P50549 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ETV1P50549 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ETV1P50549 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ETV1P50549 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ETV1P50549 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ETV1P50549 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ETV1P50549 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ETV1P50549 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ETV1P50549 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ETV1P50549 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ETV1P50549 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ETV1P50549 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ETV1P50549 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ETV1P50549 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ETV1P50549 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ETV1P50549 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ETV1P50549 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ETV1P50549 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ETV1P50549 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ETV1P50549 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ETV1P50549 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ETV1P50549 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ETV1P50549 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ETV1P50549 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ETV1P50549 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ETV1P50549 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ETV1P50549 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ETV1P50549 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ETV1P50549 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ETV1P50549 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ETV1P50549 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ETV1P50549 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ETV1P50549 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ETV1P50549 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ETV1P50549 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ETV1P50549 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ETV1P50549 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ETV1P50549 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ETV1P50549 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ETV1P50549 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ETV1P50549 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ETV1P50549 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ETV1P50549 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ETV1P50549 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ETV1P50549 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ETV1P50549 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ETV1P50549 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ETV1P50549 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ETV1P50549 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ETV1P50549 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ETV1P50549 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ETV1P50549 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ETV1P50549 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ETV1P50549 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ETV1P50549 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ETV1P50549 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms