Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSK3BP49841 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSK3BP49841 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms