Protein–RNA interactions for Protein: P49756

RBM25, RNA-binding protein 25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM25P49756 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM25P49756 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM25P49756 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM25P49756 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM25P49756 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM25P49756 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM25P49756 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RBM25P49756 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM25P49756 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM25P49756 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM25P49756 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM25P49756 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM25P49756 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM25P49756 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM25P49756 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM25P49756 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM25P49756 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM25P49756 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM25P49756 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM25P49756 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM25P49756 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM25P49756 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM25P49756 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM25P49756 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM25P49756 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM25P49756 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM25P49756 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM25P49756 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM25P49756 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM25P49756 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM25P49756 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM25P49756 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM25P49756 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM25P49756 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM25P49756 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM25P49756 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM25P49756 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM25P49756 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM25P49756 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM25P49756 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM25P49756 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM25P49756 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM25P49756 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM25P49756 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM25P49756 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM25P49756 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM25P49756 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM25P49756 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBM25P49756 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBM25P49756 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBM25P49756 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBM25P49756 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBM25P49756 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBM25P49756 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM25P49756 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM25P49756 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM25P49756 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM25P49756 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM25P49756 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM25P49756 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM25P49756 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM25P49756 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM25P49756 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM25P49756 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM25P49756 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM25P49756 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM25P49756 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM25P49756 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM25P49756 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM25P49756 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM25P49756 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM25P49756 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM25P49756 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM25P49756 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM25P49756 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM25P49756 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM25P49756 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM25P49756 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM25P49756 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM25P49756 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM25P49756 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM25P49756 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM25P49756 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM25P49756 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM25P49756 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM25P49756 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM25P49756 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBM25P49756 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBM25P49756 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBM25P49756 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBM25P49756 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RBM25P49756 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM25P49756 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM25P49756 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM25P49756 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM25P49756 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM25P49756 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM25P49756 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM25P49756 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM25P49756 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms