Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA8P48165 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA8P48165 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA8P48165 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA8P48165 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GJA8P48165 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA8P48165 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA8P48165 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA8P48165 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA8P48165 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA8P48165 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA8P48165 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA8P48165 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA8P48165 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA8P48165 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA8P48165 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA8P48165 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA8P48165 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA8P48165 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA8P48165 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA8P48165 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA8P48165 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA8P48165 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA8P48165 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA8P48165 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA8P48165 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA8P48165 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA8P48165 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA8P48165 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA8P48165 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA8P48165 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA8P48165 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA8P48165 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA8P48165 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA8P48165 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA8P48165 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA8P48165 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA8P48165 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA8P48165 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA8P48165 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA8P48165 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA8P48165 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA8P48165 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA8P48165 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA8P48165 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA8P48165 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA8P48165 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJA8P48165 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJA8P48165 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJA8P48165 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJA8P48165 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJA8P48165 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJA8P48165 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA8P48165 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA8P48165 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA8P48165 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA8P48165 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA8P48165 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA8P48165 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA8P48165 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA8P48165 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA8P48165 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA8P48165 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA8P48165 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA8P48165 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA8P48165 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA8P48165 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA8P48165 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA8P48165 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA8P48165 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJA8P48165 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJA8P48165 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GJA8P48165 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA8P48165 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA8P48165 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA8P48165 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA8P48165 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA8P48165 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA8P48165 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA8P48165 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA8P48165 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA8P48165 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA8P48165 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA8P48165 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA8P48165 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA8P48165 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA8P48165 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA8P48165 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA8P48165 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJA8P48165 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJA8P48165 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJA8P48165 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GJA8P48165 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJA8P48165 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJA8P48165 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJA8P48165 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJA8P48165 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJA8P48165 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GJA8P48165 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJA8P48165 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms