Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms