Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETV4P43268 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETV4P43268 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETV4P43268 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETV4P43268 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETV4P43268 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETV4P43268 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ETV4P43268 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ETV4P43268 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETV4P43268 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETV4P43268 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETV4P43268 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETV4P43268 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETV4P43268 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETV4P43268 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETV4P43268 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETV4P43268 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV4P43268 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV4P43268 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV4P43268 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV4P43268 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV4P43268 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV4P43268 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV4P43268 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV4P43268 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETV4P43268 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETV4P43268 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETV4P43268 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETV4P43268 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETV4P43268 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETV4P43268 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETV4P43268 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETV4P43268 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETV4P43268 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETV4P43268 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETV4P43268 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETV4P43268 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETV4P43268 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETV4P43268 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETV4P43268 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETV4P43268 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETV4P43268 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETV4P43268 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETV4P43268 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETV4P43268 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETV4P43268 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETV4P43268 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETV4P43268 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETV4P43268 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETV4P43268 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETV4P43268 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETV4P43268 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETV4P43268 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETV4P43268 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETV4P43268 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETV4P43268 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETV4P43268 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETV4P43268 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETV4P43268 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETV4P43268 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETV4P43268 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETV4P43268 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETV4P43268 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETV4P43268 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETV4P43268 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETV4P43268 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETV4P43268 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETV4P43268 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETV4P43268 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETV4P43268 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETV4P43268 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ETV4P43268 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETV4P43268 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETV4P43268 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ETV4P43268 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ETV4P43268 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ETV4P43268 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETV4P43268 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETV4P43268 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETV4P43268 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETV4P43268 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETV4P43268 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETV4P43268 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETV4P43268 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETV4P43268 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETV4P43268 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETV4P43268 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETV4P43268 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETV4P43268 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETV4P43268 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETV4P43268 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETV4P43268 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETV4P43268 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETV4P43268 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETV4P43268 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETV4P43268 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETV4P43268 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETV4P43268 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETV4P43268 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETV4P43268 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms