Protein–RNA interactions for Protein: P43243

MATR3, Matrin-3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATR3P43243 MECP2-209ENST00000486506 2907 ntTSL 58.55□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 28.4
MATR3P43243 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.722e-7■■■■■ 28.4
MATR3P43243 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 28.4
MATR3P43243 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 28.4
MATR3P43243 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.193e-7■■■■■ 28.4
MATR3P43243 SPATS2L-220ENST00000457757 835 ntTSL 519.8■□□□□ 0.763e-7■■■■■ 28.4
MATR3P43243 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.663e-7■■■■■ 28.4
MATR3P43243 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.473e-7■■■■■ 28.4
MATR3P43243 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 28.4
MATR3P43243 SPATS2L-208ENST00000409718 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 28.4
MATR3P43243 SPATS2L-206ENST00000409385 2320 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 28.4
MATR3P43243 SPATS2L-219ENST00000453663 637 ntTSL 410.58□□□□□ -0.723e-7■■■■■ 28.4
MATR3P43243 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.883e-7■■■■■ 28.4
MATR3P43243 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.893e-7■■■■■ 28.4
MATR3P43243 SPATS2L-207ENST00000409397 920 ntTSL 39.37□□□□□ -0.913e-7■■■■■ 28.4
MATR3P43243 EHMT1-249ENST00000637949 575 ntTSL 59.7□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 28.4
MATR3P43243 PARP12-204ENST00000470515 564 ntTSL 37.94□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 28.3
MATR3P43243 NEK1-201ENST00000439128 5653 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 28.3
MATR3P43243 NEK1-206ENST00000510533 5377 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 28.3
MATR3P43243 NEK1-203ENST00000507142 5556 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 28.3
MATR3P43243 NEK1-207ENST00000511633 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 28.3
MATR3P43243 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 28.3
MATR3P43243 NEK1-204ENST00000509912 2971 ntTSL 24.97□□□□□ -1.611e-6■■■■■ 28.3
MATR3P43243 TMEM38B-202ENST00000374692 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 28.3
MATR3P43243 TMEM38B-204ENST00000435034 721 ntTSL 36.1□□□□□ -1.433e-6■■■■■ 28.3
MATR3P43243 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.683e-6■■■■■ 28.3
MATR3P43243 PSMB1-202ENST00000462957 1939 ntTSL 25.96□□□□□ -1.461e-7■■■■■ 28.3
MATR3P43243 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.511e-6■■■■■ 28.3
MATR3P43243 SKI-204ENST00000508416 252 ntTSL 311.57□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 28.3
MATR3P43243 ACTR3-204ENST00000446821 818 ntTSL 318.02■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 28.2
MATR3P43243 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 28.2
MATR3P43243 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 28.2
MATR3P43243 ACTR3-202ENST00000415792 676 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 28.2
MATR3P43243 ACTR3-206ENST00000484165 676 ntTSL 24.17□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 28.2
MATR3P43243 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.526e-7■■■■■ 28.2
MATR3P43243 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.476e-7■■■■■ 28.2
MATR3P43243 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.456e-7■■■■■ 28.2
MATR3P43243 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.456e-7■■■■■ 28.2
MATR3P43243 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.666e-7■■■■■ 28.2
MATR3P43243 ST7-217ENST00000446490 1694 ntTSL 58.56□□□□□ -1.046e-7■■■■■ 28.2
MATR3P43243 ST7-216ENST00000443979 805 ntTSL 57.96□□□□□ -1.146e-7■■■■■ 28.2
MATR3P43243 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.558e-7■■■■■ 28.2
MATR3P43243 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.474e-7■■■■■ 28.2
MATR3P43243 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.114e-7■■■■■ 28.2
MATR3P43243 DAD1-204ENST00000538631 441 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 28.2
MATR3P43243 DAD1-203ENST00000535847 591 ntTSL 29.89□□□□□ -0.834e-7■■■■■ 28.2
MATR3P43243 DNAJC6-205ENST00000472787 519 ntTSL 32.91□□□□□ -1.942e-6■■■■■ 28.1
MATR3P43243 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.089e-7■■■■■ 28.1
MATR3P43243 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.129e-7■■■■■ 28.1
MATR3P43243 GOLGA4-201ENST00000356847 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.269e-7■■■■■ 28.1
MATR3P43243 GOLGA4-207ENST00000437131 6947 ntTSL 1 (best)2.49□□□□□ -2.019e-7■■■■■ 28.1
MATR3P43243 TAL1-206ENST00000481091 504 ntTSL 316.89■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 28.1
MATR3P43243 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.298e-7■■■■■ 28.1
MATR3P43243 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.178e-7■■■■■ 28.1
MATR3P43243 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.058e-7■■■■■ 28.1
MATR3P43243 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.037e-8■■■■■ 28.1
MATR3P43243 SLC13A5-201ENST00000293800 3176 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.428e-7■■■■■ 28.1
MATR3P43243 SPIDR-211ENST00000519401 2090 ntTSL 212.39□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 28.1
MATR3P43243 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 28.1
MATR3P43243 MAGEC1-201ENST00000285879 4270 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 28.1
MATR3P43243 GNB1-206ENST00000471354 1512 ntTSL 516.99■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 28
MATR3P43243 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 28
MATR3P43243 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 28
MATR3P43243 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 28
MATR3P43243 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 28
MATR3P43243 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.522e-6■■■■■ 28
MATR3P43243 FAM135A-201ENST00000194672 5198 ntTSL 52.02□□□□□ -2.092e-6■■■■■ 28
MATR3P43243 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.182e-6■■■■■ 28
MATR3P43243 NUBPL-209ENST00000551015 577 ntTSL 411.96□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 28
MATR3P43243 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.672e-19■■■■■ 28
MATR3P43243 N4BP1-202ENST00000564124 2485 ntTSL 514.84□□□□□ -0.032e-19■■■■■ 28
MATR3P43243 N4BP1-203ENST00000564710 540 ntTSL 49.25□□□□□ -0.932e-19■■■■■ 28
MATR3P43243 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.431e-6■■■■■ 28
MATR3P43243 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.28e-7■■■■■ 28
MATR3P43243 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.788e-7■■■■■ 28
MATR3P43243 DNTTIP2-201ENST00000359208 2199 ntTSL 28.48□□□□□ -1.057e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.487e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.747e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.268e-7■■■■■ 27.9
MATR3P43243 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.558e-7■■■■■ 27.9
MATR3P43243 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.658e-7■■■■■ 27.9
MATR3P43243 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.668e-7■■■■■ 27.9
MATR3P43243 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.966e-9■■■■■ 27.9
MATR3P43243 AZIN1-207ENST00000520402 660 ntTSL 414.65□□□□□ -0.066e-9■■■■■ 27.9
MATR3P43243 AZIN1-202ENST00000347770 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.746e-9■■■■■ 27.9
MATR3P43243 AZIN1-203ENST00000517581 576 ntTSL 410.21□□□□□ -0.776e-9■■■■■ 27.9
MATR3P43243 AZIN1-204ENST00000518353 773 ntTSL 57.65□□□□□ -1.186e-9■■■■■ 27.9
MATR3P43243 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.589e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.639e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.329e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.693e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.423e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.373e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.043e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.82e-15■■■■■ 27.9
MATR3P43243 BCL2L1-208ENST00000450273 894 ntTSL 319.84■□□□□ 0.772e-11■■■■■ 27.9
MATR3P43243 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.713e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 ZNF618-206ENST00000481558 1126 ntTSL 518.81■□□□□ 0.63e-8■■■■■ 27.9
MATR3P43243 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.552e-15■■■■■ 27.9
MATR3P43243 POLE2-210ENST00000556584 1568 ntTSL 517.11■□□□□ 0.333e-8■■■■■ 27.9
Retrieved 100 of 16,209 protein–RNA pairs in 67 ms