Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGFRP43088 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGFRP43088 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms