Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3CAP42336 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3CAP42336 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3CAP42336 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms