Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FEN1P39748 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FEN1P39748 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FEN1P39748 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FEN1P39748 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FEN1P39748 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FEN1P39748 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FEN1P39748 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FEN1P39748 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FEN1P39748 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FEN1P39748 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FEN1P39748 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FEN1P39748 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FEN1P39748 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FEN1P39748 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FEN1P39748 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FEN1P39748 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FEN1P39748 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FEN1P39748 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FEN1P39748 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FEN1P39748 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FEN1P39748 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FEN1P39748 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FEN1P39748 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FEN1P39748 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FEN1P39748 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FEN1P39748 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FEN1P39748 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FEN1P39748 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FEN1P39748 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FEN1P39748 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FEN1P39748 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FEN1P39748 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FEN1P39748 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FEN1P39748 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FEN1P39748 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FEN1P39748 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FEN1P39748 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FEN1P39748 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FEN1P39748 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FEN1P39748 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FEN1P39748 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FEN1P39748 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FEN1P39748 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FEN1P39748 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FEN1P39748 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FEN1P39748 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FEN1P39748 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FEN1P39748 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FEN1P39748 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FEN1P39748 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FEN1P39748 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FEN1P39748 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FEN1P39748 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FEN1P39748 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FEN1P39748 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FEN1P39748 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FEN1P39748 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FEN1P39748 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FEN1P39748 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FEN1P39748 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FEN1P39748 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FEN1P39748 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FEN1P39748 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FEN1P39748 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FEN1P39748 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FEN1P39748 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FEN1P39748 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FEN1P39748 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FEN1P39748 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FEN1P39748 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FEN1P39748 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FEN1P39748 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FEN1P39748 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FEN1P39748 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FEN1P39748 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FEN1P39748 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FEN1P39748 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FEN1P39748 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FEN1P39748 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FEN1P39748 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FEN1P39748 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FEN1P39748 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FEN1P39748 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FEN1P39748 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FEN1P39748 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FEN1P39748 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FEN1P39748 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FEN1P39748 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FEN1P39748 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FEN1P39748 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FEN1P39748 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FEN1P39748 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FEN1P39748 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FEN1P39748 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FEN1P39748 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FEN1P39748 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FEN1P39748 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FEN1P39748 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FEN1P39748 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms