Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSPA9P38646 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA9P38646 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA9P38646 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms