Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT9P35527 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT9P35527 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT9P35527 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT9P35527 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT9P35527 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT9P35527 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT9P35527 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT9P35527 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT9P35527 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT9P35527 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT9P35527 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT9P35527 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT9P35527 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT9P35527 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT9P35527 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT9P35527 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT9P35527 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT9P35527 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT9P35527 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT9P35527 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT9P35527 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT9P35527 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT9P35527 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT9P35527 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT9P35527 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT9P35527 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT9P35527 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT9P35527 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT9P35527 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT9P35527 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT9P35527 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT9P35527 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT9P35527 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT9P35527 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT9P35527 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT9P35527 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT9P35527 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT9P35527 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT9P35527 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT9P35527 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT9P35527 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT9P35527 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT9P35527 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT9P35527 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT9P35527 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT9P35527 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT9P35527 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT9P35527 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT9P35527 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT9P35527 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT9P35527 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT9P35527 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT9P35527 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT9P35527 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT9P35527 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT9P35527 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT9P35527 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT9P35527 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT9P35527 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT9P35527 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT9P35527 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT9P35527 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT9P35527 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT9P35527 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT9P35527 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT9P35527 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT9P35527 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT9P35527 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT9P35527 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT9P35527 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT9P35527 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT9P35527 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT9P35527 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT9P35527 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT9P35527 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT9P35527 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT9P35527 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT9P35527 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT9P35527 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT9P35527 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT9P35527 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT9P35527 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT9P35527 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT9P35527 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT9P35527 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT9P35527 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT9P35527 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT9P35527 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT9P35527 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT9P35527 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT9P35527 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT9P35527 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT9P35527 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT9P35527 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT9P35527 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT9P35527 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT9P35527 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT9P35527 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT9P35527 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms