Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC1P35052 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC1P35052 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC1P35052 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC1P35052 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC1P35052 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC1P35052 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC1P35052 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC1P35052 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC1P35052 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC1P35052 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC1P35052 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC1P35052 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC1P35052 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC1P35052 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC1P35052 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC1P35052 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC1P35052 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC1P35052 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPC1P35052 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC1P35052 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC1P35052 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC1P35052 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC1P35052 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC1P35052 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC1P35052 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC1P35052 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC1P35052 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC1P35052 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPC1P35052 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC1P35052 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC1P35052 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC1P35052 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC1P35052 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC1P35052 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC1P35052 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPC1P35052 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC1P35052 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC1P35052 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC1P35052 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC1P35052 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC1P35052 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC1P35052 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC1P35052 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC1P35052 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC1P35052 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC1P35052 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC1P35052 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC1P35052 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC1P35052 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC1P35052 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC1P35052 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC1P35052 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC1P35052 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPC1P35052 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC1P35052 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC1P35052 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC1P35052 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC1P35052 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC1P35052 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC1P35052 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC1P35052 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC1P35052 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC1P35052 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC1P35052 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC1P35052 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC1P35052 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC1P35052 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC1P35052 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC1P35052 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC1P35052 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC1P35052 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC1P35052 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC1P35052 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC1P35052 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC1P35052 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC1P35052 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC1P35052 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC1P35052 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC1P35052 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC1P35052 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC1P35052 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC1P35052 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC1P35052 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC1P35052 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC1P35052 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC1P35052 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC1P35052 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC1P35052 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC1P35052 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC1P35052 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC1P35052 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC1P35052 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC1P35052 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC1P35052 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC1P35052 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC1P35052 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC1P35052 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC1P35052 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC1P35052 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms