Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPOP30536 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPOP30536 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSPOP30536 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSPOP30536 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSPOP30536 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSPOP30536 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TSPOP30536 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSPOP30536 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSPOP30536 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSPOP30536 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSPOP30536 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSPOP30536 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSPOP30536 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSPOP30536 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSPOP30536 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSPOP30536 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSPOP30536 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSPOP30536 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSPOP30536 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSPOP30536 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSPOP30536 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSPOP30536 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSPOP30536 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSPOP30536 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSPOP30536 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSPOP30536 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSPOP30536 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSPOP30536 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSPOP30536 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSPOP30536 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSPOP30536 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TSPOP30536 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSPOP30536 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TSPOP30536 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSPOP30536 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TSPOP30536 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSPOP30536 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSPOP30536 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSPOP30536 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSPOP30536 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TSPOP30536 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSPOP30536 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSPOP30536 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSPOP30536 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSPOP30536 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSPOP30536 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSPOP30536 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSPOP30536 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSPOP30536 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPOP30536 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPOP30536 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPOP30536 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPOP30536 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPOP30536 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPOP30536 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPOP30536 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPOP30536 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPOP30536 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPOP30536 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPOP30536 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPOP30536 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPOP30536 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPOP30536 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPOP30536 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPOP30536 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPOP30536 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPOP30536 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSPOP30536 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSPOP30536 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSPOP30536 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSPOP30536 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSPOP30536 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSPOP30536 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSPOP30536 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSPOP30536 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSPOP30536 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSPOP30536 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSPOP30536 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSPOP30536 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSPOP30536 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSPOP30536 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSPOP30536 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSPOP30536 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSPOP30536 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSPOP30536 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSPOP30536 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSPOP30536 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSPOP30536 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSPOP30536 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSPOP30536 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSPOP30536 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSPOP30536 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSPOP30536 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSPOP30536 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TSPOP30536 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSPOP30536 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSPOP30536 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSPOP30536 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSPOP30536 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms