Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CNGA1P29973 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNGA1P29973 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms